北京新发地 北京新发地市场的病毒来自何方 最新结论来了

北京新发地市场聚集性疫情的病毒源自何方？最新结论来了！

10月23日，清华大学、北京市疾病预防控制中心、中国医学科学院病原生物学研究所、北京大学和中国科学院北京基因组研究所在《国家科学评论》联合发文。通过分析相关病例、环境和食品样本的核酸测序和病毒基因组序列，结合综合流行病学调查和大数据分析，研究人员揭示此次疫情中的病毒来源极有可能是境外疫区的冷链进口食品，并提出冷链运输或

论文电子截图

2020年6月11日，1例新冠病毒感染患者突现，打破了北京连续56天无新增病例的平静。该患者马上就被收治，病情也很快得到控制，但是他从何处感染了病毒，却成了一个谜。

结合指示病例流行病学调查和大数据分析，通过对地区和接触者的调查，发现北京新发地市场2份环境样本新冠肺炎核酸阳性。随后，新发地市场538名员工接受病毒核酸筛查，45人阳性。新发地市场随即成为关注焦点，北京相关部门果断采取关闭市场措施，有效遏制疫情蔓延。

6月中旬，北京进一步推进核酸筛查，共发现368人新冠病毒核酸阳性。这些感染者均与新发地市场有直接或者间接关联：其中169人是新发地市场的工作人员，103人于5月30日至6月12日期间去过新发地市场，其余96人均为上述人员的接触者。未发现独立于该市场的早期传播链或独立传播链，提示新发地市场是此次疫情暴发的单一源头。

新发地综合交易大厅负一层感染工人分布情况。

结合新发地市场流行病学调查，研究人员初步确定综合交易大厅地下一层水产区S14号摊位可能是感染的源头：S14号摊位的7位工作人员均为新冠确诊病例，且症状出现时间相对较早。根据流行病学模型推断的疫情开始时间范围内，共有5位顾客新冠抗体检测阳性，且这5位顾客都到访过S14号摊位。这5位顾客及其密切接触者在过去14天内都未到访过中高风险区域或接触来自中高风险区域的人员，进一步提示疫情是由新发地市场向外传播。

对新发地市场聚集性疫情中从病例和环境样本中获得的病毒基因组序列进行分析，发现病毒序列具有明显的突变特征，与国内之前发现的本土和输入性病例有所不同，揭示疫情应该从国外输入。

研究团队进一步利用自主开发的低病毒载量样品处理方法，对110个病例和环境样本进行了高通量核酸测序，共获得了72条高质量的新冠病毒基因组序列。分析发现，这些序列均具有8个特征性突变位点，这些位点在我国此前的本土和输入病例中从未发现过。与新冠病毒基因序列数据库比对，发现除C6026T突变位点之外，具有其它7个突变位点的病毒主要存在于欧洲。这些结果进一步提示本次疫情的病毒应为单一性的新发境外输入。

对新一轮疫情中从病例和环境样本中获得的病毒基因组序列进行分析，发现病毒序列具有明显的突变特征，与之前在国内发现的本土和输入病例有所不同，揭示疫情应该是从国外输入的。

综合上述结果，同时确认S14号摊位的工作人员未接触过疑似或确诊新冠病毒感染者，且5月至6月初期北京也无报告新增感染病例，提示病毒极可能来源于境外输入。进一步调查显示，S14号摊位售卖的物品中冰鲜三文鱼是唯一来自境外的商品，且摊主曾于5月30日从某供应商处采买过从存在新冠病毒疫情国家进口、包装完整的三文鱼，在市场内切割处理后零售。为此，研究人员对新发地市场内所有三文鱼供应商的冷库进行了采样检测，发现某供应商有5份鱼体拭子样本呈新冠病毒核酸阳性，其中1份未开封鱼体拭子样本中测序获得的病毒基因组序列与本次疫情中人和环境样本中的病毒高度同源。

因为活病毒不能从鱼身上分离出来，所以无法证明病毒对鱼的活性。但结合高质量病毒基因组序列特征分析和流行病学调查，提示来自境外高发地区的冷链进口食品极有可能是这一新市场集中流行病毒的来源。文章发表期间，中国疾控中心报道，从青岛获得的冷链食品中分离出新冠肺炎，进一步提示冷链食品可能是在新冠肺炎传播的重要途径。该研究为揭示北京新发地市场聚集性疫情的病毒来源提供了重要证据，为优化疫情常态化防控策略提供了重要依据。

研究中，多家机构开展精诚合作。其中，北京市疾病预防控制中心新冠病毒肺炎防控和检测组参与完成现场调查、样本采集和核酸筛查。中国医学科学院病原生物学研究所王健伟、任丽丽研究团队在P3实验室完成了样品的核酸测序前处理流程。清华大学王建斌课题组与北京大学黄岩谊课题组发展的快速基因组测序样品处理方法为本次疫情关键样品的准确快速病毒测序提供了技术基础和实验支持。中国科学院北京基因组研究所李明锟课题组完成了对关键样品序列的分析。

北京市疾病预防控制中心主任医师庞、中国医学科学院病原生物学研究所研究员吴、中国科学院北京基因组研究所研究生泰为论文共同第一作者。

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来源：北京日报客户端

原标题:“北京新发地市场的病毒从何而来？最新的结论来了。”